或許因為背後有著《摩斯拉 vs 霸剛》（モスラ vs バガン）的初始原案，使得 1992 年底推出的《哥吉拉 vs 摩斯拉》（ゴジラ vs モスラ，昔日台譯：蝶龍魔斯拉）呈現出一種以摩斯拉（モスラ）和巴特拉（バトラ）為主角的異樣氣氛；不過該片中的哥老大淪為配角，倒是和 1964 年《摩斯拉對哥吉拉》（モスラ対ゴジラ）有著異曲同工之妙。
《哥吉拉 vs 摩斯拉》電影海報。
故事起於一顆環境已逐漸崩壞的世紀末地球上，因隕石撞擊，讓沈睡中的怪獸哥吉拉率先復活；接著嬰兒島上因開發與風災造成的坍方中，又發現了摩斯拉的卵；呼應著怪獸的現身，巴特拉的幼蟲也跟著從北方海域中復活。
摩斯拉之歌再度響起！小美人雙雙現身
片中，在小美人揭露的自身歷史中，地球上原本有著崇拜摩斯拉的超古代文明，但因為科學家開始控制氣候，促使地球本身創造了巴特拉出來毀滅文明。雖然摩斯拉將巴特拉封入海中，但遭破壞的氣候控制設施所產生的大洪水，依舊完成了巴特拉的任務。如今，各種人為天災導致遠古怪獸復活，還加上了核彈促生的哥吉拉，這也使得小美人必須現身，呼籲發現她們的人類停止傷害地球，以免文明再度遭到毀滅。
小美人現身了。
接下來的劇情倒是有點類似《金剛對哥吉拉》（キングコング対ゴジラ）與摩斯拉系列的合體：嬰兒島的開發商先是弄了艘巨大駁船想把整顆卵拖回日本，卻在半路遭遇哥吉拉和巴特拉襲擊，演變成三隻怪獸對打；其後又把腦筋動到小美人頭上，把她們抓來企圖當公司宣傳品。
