接下來該怎麼辦？史匹柏與盧卡斯原本就決定讓瓊斯演出三部曲，他們原本想在《魔宮傳奇》裡展現考古任務的黑暗面——怎麼可能世界各地的原始部落都和善待人呢？但這種嘗試失敗了。他們知道應該讓瓊斯回到那個傻傻冒險、然後跑給滾石追的簡潔冒險風格，問題是，這樣似乎又只是在重複《法櫃奇兵》的後路。而在《魔宮傳奇》的評價失敗後，全世界正好奇他們會不會重拍一部《法櫃奇兵》復刻版，這讓史匹柏傷透腦筋——即便他真的願意重蹈覆轍，觀眾也早已看破他的手腳，這部第三集將會未演先衰。
《法櫃奇兵》。
所以第三集一定要變，問題是該怎麼變。這部第三集變換了不知多少版劇本與不同風格，最知名的一個版本名為《印第安納瓊斯與美猴王》(Indiana Jones and the Monkey King) ——對，你沒看錯。盧卡斯寫了 8 頁劇本，描述印第安納瓊斯追尋聖杯，到了一個秘境都市，他發現這是由孫悟空統治的城市，這裡由一隻巨型人猿與牠的大猩猩軍隊管控一切，而牠們不太喜歡美國考古學家來此撒野。你可以想像，孫悟空應該最終會與瓊斯大打一架（抄起如意棒），或是他們最終會攜手合作，共同對抗相同的敵人：差不多是納粹。
史匹柏與盧卡斯。
印第安納瓊斯第三集不但曾經是《西遊記》外傳、還曾經是《小氣財神》番外篇、曾經是鬼片（瓊斯會遇上一群蘇格蘭鬼魂）、曾經是災難片（瓊斯必須阻止亞特蘭提斯帝國二度毀滅）、曾經是愛情片（瓊斯必須面對他意外的私生子，沒錯，你知道這個設定後來又復活了）。說實話，以史匹柏的才氣，他如果選擇這些亂七八糟的點子其中一個拍成電影，甚至可能都不會太難看。只是，這部第三集也可能不會放在「這些電影第三集很好看！」的專題裡了。
私生子。
史匹柏對《聖戰奇兵》最自豪之處，在於他最終決定，讓印第安納瓊斯的父親登場。某種程度上，《聖戰奇兵》進行了「第三集歷史」上最激烈的軟開機過程：你還是看得到瓊斯、還是看得到他的招牌趕牛神鞭，但是《聖戰奇兵》卻與它的前兩部電影截然不同。它的重點不再是奪寶、不再是納粹、不再是愛情與那些墓穴裡的機關。《聖戰奇兵》是動作片類型裡最罕見的一部作品，它碰觸所有熱愛動作電影類型的男性觀眾、最不願碰觸的弱點：父子關係。
《聖戰奇兵》。
一般的動作電影裡，毫無父子關係可言，因為父親的存在，就是拿來讓兒子復仇之用——父親必須被殺、父親必須死前告訴孩子「能力越強、責任越大」、父親只能在電影前半段出現，然後就去領便當。但是《聖戰奇兵》不同，這是一部讓關係惡劣的父子，試圖恢復健康關係的電影。印第與他的父親亨利已經有好久好久沒有聯繫，但是，聖杯成為他們重拾父子情的關鍵。而不管是兒子還是父親，他們同時也都想縮短兩人之間的距離。
而《聖戰奇兵》從電影開場，就要強調這對考古學家父子之間的感情，到底有多差。