串起近半世紀的摩斯拉歷史，回歸、登場更「致敬」
延續前作，擊退哥吉拉的機龍嚴重損壞，需要大幅整修；同時，上一戰的英雄家城茜也離開了戰場。但在哥吉拉重現前，意外登場的卻是摩斯拉以及小美人，而這次她們對人類的懇求，卻成了日本人的難題：她們希望人類將哥吉拉的骨骸還給大海，也等於將唯一能抵擋哥吉拉的機龍捨棄掉。
小美人。
《東京 SOS》在開啟這條故事線時，用上了一個雖然非系列首創、但仍舊令影迷喜愛的手法：就如 1995 年《哥吉拉 vs 戴斯特洛伊亞》（ゴジラ vs デストロイア）中，讓飾演元祖《哥吉拉》女主角的河內桃子再度扮演同角色一樣，《東京SOS》也讓 1961 年《摩斯拉》的主要演員小泉博再度登場，飾演四十二年前率先與小美人溝通的語言學者中條信一，讓本片直接和元祖《摩斯拉》的故事線連結起來。
1961 年《摩斯拉》片中的中條信一（小泉博 飾）。
2003 年《東京 SOS》中的中條信一（小泉博 飾）。
然而，和本片有關的摩斯拉電影還不只《摩斯拉》而已。本片先是有成蟲摩斯拉挺身迎戰哥吉拉，接著牠預先在小笠原產下的卵也孵出了雙胞胎幼蟲；其後摩斯拉為了保護後代犧牲，幼蟲便繼續以吐絲攻擊來延續使命──這很明顯地重複了 1964 年電影《摩斯拉對哥吉拉》（モスラ対ゴジラ）的劇情，就算是致敬，恐怕也太直白了一些。
哥吉拉以類似 1964 年的方式遭裹住而敗北。
無論如何，有關摩斯拉的種種安排確實滿足了懷舊方面的需求。那麼，在機械哥吉拉的部分，是否能夠有所創新呢……（未完待續）
