和 1992 年《哥吉拉 vs 摩斯拉》（ゴジラvs モスラ）以降的前三作相比，《哥吉拉 vs 戴斯特洛伊亞》（ゴジラ vs デストロイア）可說是脫胎換骨，或者該說是終於回歸了《哥吉拉 vs 碧奧蘭蒂》（ゴジラ vs ビオランテ）及《哥吉拉 vs 王者基多拉》（ゴジラ vs キングギドラ）的水準。不過上述兩部片的導演大森一樹在本片僅僅是回歸劇本寫作，導演仍是之前執導《哥吉拉 vs 摩斯拉》與《哥吉拉 vs 機械哥吉拉》（ゴジラ vs メカゴジラ）的大河原孝夫。
幸好，《哥吉拉 vs 戴斯特洛伊亞》展現的嚴肅、緊湊與魄力，都不太會令人想起他自己前兩作的鬆散不俐落。
電影終幕。
承襲元祖哥吉拉精神，畫下平成系列句點
讓大河原孝夫總算能發揮全力、拍出高水準哥吉拉電影的關鍵，最有可能是本片一開始選定的題材與基調──也就是直接承襲元祖《哥吉拉》的一切。雖然說 1955 年火速拍出的續集《哥吉拉的逆襲》（ゴジラの逆襲）就曾經延續前作劇情並讓山根博士二度登場，但除了他和哥吉拉外，這部喜劇片和前作可說毫無關聯，實質上真正堪稱元祖《哥吉拉》續作的，還是只有這部《哥吉拉 vs 戴斯特洛伊亞》。
本片中，「氧氣破壞劑」對東京灣的殺傷力過了四十多年依舊存在，促使原本休眠灣底的厭氧生物重生，並一路變化成大小超越哥吉拉的戴斯特洛伊亞。除了氧氣破壞劑之外，還有一名令人無比懷念的角色，也在四十年後回來延續故事；她就是當年出於惻隱之心而揭露芹澤博士的秘密、最終間接迫使他犧牲的女主角，山根惠美子。
第一部哥吉拉電影的女主角，由河內桃子飾演山根惠美子。
她不僅以當年的切身之痛告誡下一代不要重蹈科學誤用的覆轍，更在午夜夢迴中帶觀眾重溫四十年前的精典片段。當年的年輕演員河內桃子以真實歲月累積的垂暮之姿，在銀幕上再續當年劇終後的悔憾，堪稱是哥吉拉系列最扣人心弦的一幕。
回歸哥吉拉完結篇的河內桃子。
超能力少女三枝未希與哥吉拉二世
令人感傷的還有一路伴隨系列作的「超能力少女」三枝未希。處在人獸之間的兩難到了本片終於退無可退──為了避免全地球因哥吉拉失控而化成灰燼，她必須以精神力引導外形已是哥吉拉二世的小哥吉拉前往東京，藉以吸引身體已在燃燒發紅的哥吉拉前來和戴斯特洛伊亞互鬥，也害一心想回北方小島（見《哥吉拉 vs 機械哥吉拉》）的二世死在戴斯特洛伊亞手上。
